まずこのように選択ツールで直線を掴んで曲げます。

次にこの選択を解除した後、アンドゥボタンもしくはCtrl+Zで元に戻すとこのとおり。

角が綺麗になりました。

これを全部の直線に対して行います。

このままだと直線がぼやけて嫌だという人はプロパティウインドウで0.5ずつxとy方向へずらすと直線がはっきりします。
（個人的にはずらさないほうが、接続が綺麗で好きです。個人の好みでどうぞ。）

最初のものとの比較です。

左にあった妙なでっぱりが消えているのがわかると思います。

このほかに、0.5ずらすだけでサイズによっては綺麗になったり、線の太さを変更するという方法もあります。
（角丸が汚くなるのは線の太さが1と3の時らしい）